在生态植物园中，花木的应用方式更具科学内涵和艺术创造性。
主题专类园应用：
药用植物园：集中展示具有药用价值的植物，并按功效或科属进行分类，兼具科普和文化价值。
岩石园：在高差变化大的区域，利用岩石和耐旱的高山、岩生植物，营造粗犷而精致的微缩景观。
水生植物园：按水深梯度配置沉水植物（狐尾藻）、浮水植物（睡莲）、挺水植物（荷花、菖蒲）和湿生植物（鸢尾），展示完整的湿地生态序列。
珍稀濒危植物区：集中迁地保育国家重点保护的野生植物，是植物园核心价值的体现。
生态修复与示范应用：
污染净化区：利用特定植物（如芦苇、香蒲）对水体进行净化；利用夹竹桃、海桐等对大气污染有较强抗性和吸收能力的植物，展示其在城市环境治理中的作用。
水土保持区：在坡地、河岸种植根系发达的植物（如紫穗槐、迎春），展示其固土护坡的功效。
文化与意境营造应用：
诗词意境：借鉴中国古典园林的手法，通过植物营造特定意境。如“松、竹、梅”构成“岁寒三友”，“荷”象征“出淤泥而不染”。
乡土文化：种植具有地方特色的果树、经济作物（如桑、茶、油桐），唤起人们的乡土记忆，传承地方文化。
互动与体验式应用：
感官花园：种植具有特殊气味（香草、栀子花）、触感（绵毛水苏、触摸即闭合的含羞草）和声音（风吹竹林、芭蕉）的植物，为视障人士和儿童提供独特的感官体验。
可食地景： 将蔬菜、香草、果树以观赏园林的方式种植，展示都市农业与景观的结合。
